MovableType 4.1での再構築時のエラー調査中

MovableType 4.1にアップグレード後、再構築時にエラーになる問題に関して、まだ原因が判らず、レンタルサーバCsidenetさんに協力をお願いし調査中です。

【エラーの状況について】
以下の様な全ての再構築時で「Error 500 Internal Server Error」のエラーとなってしまいます。個別エントリとインデックスのみの再構築については、エラーになるものの、ページ自体は出来ています。また再構築ではなく、単なる個別エントリの投稿もエラーになってします。

　・個別のエントリー投稿でエラーになる。
　・個別のエントリー投稿時の再構築でもエラーになる。
　・インデックスのみの再構築でもエラーになる。
　・カテゴリアーカイブ、月別アーカイブの再構築でもエラーになる。

【エラーログによる調査】
レンタルサーバCsidenetさんに、エラー時のログ状況を把握するため、「error_log」を設置してもらいました。ログ開始の3月11日17時以降のエラーログを確認した結果、「Premature end of script headers:」エラーとなっている事がわかりました。

　[error] Premature end of script headers: /home/xxxxxxx/public_html/cgi/mt/mt.cgi

このエラーは以前にも経験していますが、Csidenetさんに以下質問中です。

（１）以前（2005年04月頃）同様の再構築時のエラーが発生した時は、カテゴリアーカイブ、月別アーカイブの再構築でエラーになり、その時は、CGIの負荷制限に引っ掛かっているとの事でした。今回のエラー発生時も同様にCGIの負荷制限に引っ掛かっているのかどうかを確認して頂けませんでしょうか？

（２）ログには、他に以下の様なエラーが大量に確認されました。
[error] (13)Permission denied: mod_mime_magic: can't read `/home/xxxxxxx/public_html/cgi/mt/mt-comments.cgi'

そこで、以下のファイルのパーミッションを変更701→705に変更しました。
・mt.cgi、mt4i.cgi、mt-comments.cgi、mt-tb.cgiなど

以前、「suEXEC」が有効な場合は「701」で問題が無いはずとお聞きしていますが、だめなケースもあるのでしょうか？

（３）その他、原因調査のために必要な内容などがあれば、教えて頂けないでしょうか？